เพื่อให้เข้าใจหลักการทำงานของการกระตุ้นด้วยคลื่นแม่เหล็กไฟฟ้า ให้เราดูกระบวนการทางธรรมชาติของการหดตัวของกล้ามเนื้อของมนุษย์ก่อน ตัวอย่างเช่น เมื่อบุคคลทำการเคลื่อนไหวโดยสมัครใจ เยื่อหุ้มสมองสั่งการของสมองจะรับสัญญาณเฉพาะจากส่วนอื่น ๆ ของสมอง และส่งพัลส์ไปยังเซลล์ประสาทสั่งการที่จำเป็น (เซลล์ประสาท) ของไขสันหลัง เซลล์ประสาทสั่งการยึดติดกับเซลล์กล้ามเนื้อด้วยความช่วยเหลือของซอน (neurites) และส่งแรงกระตุ้นผ่านเซลล์เหล่านี้ ซึ่งจะช่วยกระตุ้นเซลล์เหล่านี้ ซึ่งจะทำให้กล้ามเนื้อหดตัว
ด้วยการกระตุ้นกล้ามเนื้อด้วยไฟฟ้า กล้ามเนื้อจะได้รับชีพจรโดยตรงซึ่งได้รับการปรับเทียบอย่างเที่ยงตรงในเชิงลึก ความถี่ และรูปร่าง โดยผ่านสมองและไขสันหลัง สิ่งนี้ทำให้พวกเขาทำสัญญาและส่งข้อมูลเกี่ยวกับการกระทำที่กระทำกลับผ่านระบบประสาท การผสมผสานการกระตุ้นด้วยไฟฟ้ากับการฝึกปฏิบัติการจริง (หรือการเลียนแบบ) สามารถเสริมสร้างการเชื่อมต่อของระบบประสาทที่มีอยู่และสร้างการเชื่อมต่อของระบบประสาทใหม่ ซึ่งจะเป็นการเพิ่มความเร็วในการตอบสนอง (ปฏิกิริยา) หลักการเดียวกันคือพื้นฐานของการรักษา ตัวอย่างเช่น หลังจากเกิดโรคหลอดเลือดสมอง เมื่อสมองของมนุษย์ไม่สามารถจำลองแรงกระตุ้นที่จำเป็นสำหรับการเคลื่อนไหวได้อย่างอิสระ สมองก็สามารถเรียนรู้ได้ด้วยความช่วยเหลือจากการกระตุ้นเทียมที่เกิดจากการตอบสนองของกล้ามเนื้อหดตัว
